近日，蔬菜研究所鱗莖類蔬菜育種與栽培創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)洋蔥課題組在Frontiers in Plant Science(IF=6.627;JCR1區(qū)，中科院2區(qū))發(fā)表了題為“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers relevant to flower stalk height in onion”的研究論文。
洋蔥(Allium cepa L.)具有重要的園藝和藥用價(jià)值，其分布廣泛，南北各地均有栽培，是國內(nèi)主栽蔬菜之一，也是出口創(chuàng)匯的主要蔬菜之一。由于洋蔥為二年生植物且其基因組龐大、重復(fù)序列較多、遺傳背景狹窄等原因，洋蔥高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和基于圖譜的基因挖掘工作一直落后于番茄等其他蔬菜作物。
本研究利用洋蔥兩個(gè)雙單倍體(DH-1×DH-17)為親本構(gòu)建的F2群體為研究材料，采用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建了洋蔥高密度遺傳圖譜。該遺傳圖譜全長928.32 cM，平均圖距0.09 cM，包含8個(gè)連鎖群，10.584個(gè)多態(tài)SLAFs、21.250個(gè)SNP標(biāo)記。利用該圖譜，首先對(duì)調(diào)控雄性可育性狀(Ms)的位點(diǎn)進(jìn)行了QTL定位，定位結(jié)果與前人一致，說明該遺傳圖譜具有較高的質(zhì)量。其次檢測到49個(gè)與花薹高度相關(guān)的SLAF標(biāo)記，其中20個(gè)SLAFs被認(rèn)為是花薹高度性狀雜種優(yōu)勢的有效有利等位變異標(biāo)記，可用于后期花薹高度相關(guān)基因或KASP標(biāo)記的開發(fā)。本研究中構(gòu)建的高質(zhì)量高密度洋蔥連鎖圖譜為洋蔥花薹高度等重要農(nóng)藝性狀的精細(xì)定位和候選基因鑒定奠定了基礎(chǔ)，也為洋蔥育種發(fā)育遺傳機(jī)制的研究提供了新思路。
蔬菜研究所李艷偉博士為該論文第一作者，吳雄研究員和劉冰江研究員為該論文的共同通訊作者。該研究得到了國家蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程的資助。原文鏈接：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1100691/full
2023年2月8日
來源：山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
